instance.data
 

Хочу зделать возможность просмотра списка ид и к нему убитых (или живых) босов на этом ид через веб интерфейс.
Кроме поля data с таблици instance ничего ненашел где может храниться инф. про босов.
После того как убил 1го боса в гуне, data = "0 3 0 0 0", после убийства 2,3 и 4 ничего не изменилось, и только после смерти 5го data = "3 3 0 0 0".
Где же тогда храниться инф. о убитых/живых?

Нужно лезть в инстанс скрипт и смотреть, какое поле за какого босса отвечает. Иначе никак.

Дак а что по поводу того что посде убийства 2,3 и 4 боса ничего в поле data не изменилось?

Вам же ясно подсказали направление где смотреть.
Значит в данжевом скрипте нет состояний для 2,3 и 4 боссов которые нужно сохранять в базе. Берите за пример других и дописывайте сами.